Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SERPINA11Q86U17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINA11Q86U17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SERPINA11Q86U17 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA11Q86U17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SERPINA11Q86U17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPINA11Q86U17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINA11Q86U17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINA11Q86U17 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINA11Q86U17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.6 ms