Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SETD3Q86TU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD3Q86TU7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD3Q86TU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD3Q86TU7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD3Q86TU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD3Q86TU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms