Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL1Q86TB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PATL1Q86TB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PATL1Q86TB9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL1Q86TB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms