Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSMD2Q7Z408 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSMD2Q7Z408 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSMD2Q7Z408 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSMD2Q7Z408 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSMD2Q7Z408 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms