Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUP54Q7Z3B4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP54Q7Z3B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUP54Q7Z3B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP54Q7Z3B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP54Q7Z3B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP54Q7Z3B4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms