Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX8Q7RTT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX8Q7RTT4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX8Q7RTT4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX8Q7RTT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX8Q7RTT4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSX8Q7RTT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX8Q7RTT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms