Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP9Q7RTR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP9Q7RTR0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NLRP9Q7RTR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP9Q7RTR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP9Q7RTR0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms