Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC80Q76M96 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC80Q76M96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC80Q76M96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC80Q76M96 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC80Q76M96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms