Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBIPQ70UQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBIPQ70UQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBIPQ70UQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBIPQ70UQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IKBIPQ70UQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKBIPQ70UQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms