Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNC2Q6ZN30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNC2Q6ZN30 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNC2Q6ZN30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNC2Q6ZN30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNC2Q6ZN30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNC2Q6ZN30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNC2Q6ZN30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms