Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRIG3Q6UXM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRIG3Q6UXM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRIG3Q6UXM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRIG3Q6UXM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRIG3Q6UXM1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIG3Q6UXM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIG3Q6UXM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms