Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMCO3Q6UWJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMCO3Q6UWJ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMCO3Q6UWJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMCO3Q6UWJ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMCO3Q6UWJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMCO3Q6UWJ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms