Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSAG1Q6PB30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CSAG1Q6PB30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CSAG1Q6PB30 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CSAG1Q6PB30 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms