Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAAP20Q6NZ36 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAAP20Q6NZ36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAAP20Q6NZ36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAAP20Q6NZ36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAAP20Q6NZ36 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAAP20Q6NZ36 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAAP20Q6NZ36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms