Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGB2Q6NT52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGB2Q6NT52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGB2Q6NT52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGB2Q6NT52 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CGB2Q6NT52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGB2Q6NT52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CGB2Q6NT52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms