Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCAPH2Q6IBW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCAPH2Q6IBW4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NCAPH2Q6IBW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NCAPH2Q6IBW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NCAPH2Q6IBW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NCAPH2Q6IBW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NCAPH2Q6IBW4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NCAPH2Q6IBW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms