Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XAF1Q6GPH4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XAF1Q6GPH4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XAF1Q6GPH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XAF1Q6GPH4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XAF1Q6GPH4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XAF1Q6GPH4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XAF1Q6GPH4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAF1Q6GPH4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XAF1Q6GPH4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms