Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP135Q66GS9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CEP135Q66GS9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP135Q66GS9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP135Q66GS9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP135Q66GS9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP135Q66GS9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP135Q66GS9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms