Protein–RNA interactions for Protein: Q641Q2

WASHC2A, WASH complex subunit 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2AQ641Q2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
WASHC2AQ641Q2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
WASHC2AQ641Q2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
WASHC2AQ641Q2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2AQ641Q2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
WASHC2AQ641Q2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2AQ641Q2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2AQ641Q2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
WASHC2AQ641Q2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
WASHC2AQ641Q2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms