Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC23Q5W5X9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC23Q5W5X9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC23Q5W5X9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC23Q5W5X9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC23Q5W5X9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC23Q5W5X9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC23Q5W5X9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC23Q5W5X9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC23Q5W5X9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC23Q5W5X9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC23Q5W5X9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC23Q5W5X9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms