Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
CHIC1Q5VXU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC45.38■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CHIC1Q5VXU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CHIC1Q5VXU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CHIC1Q5VXU3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
CHIC1Q5VXU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CHIC1Q5VXU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
CHIC1Q5VXU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CHIC1Q5VXU3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CHIC1Q5VXU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CHIC1Q5VXU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CHIC1Q5VXU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms