Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF3Q5VWG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TAF3Q5VWG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF3Q5VWG9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF3Q5VWG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF3Q5VWG9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF3Q5VWG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF3Q5VWG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms