Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YOD1Q5VVQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YOD1Q5VVQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YOD1Q5VVQ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YOD1Q5VVQ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms