Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP58Q5T655 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP58Q5T655 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP58Q5T655 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP58Q5T655 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP58Q5T655 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP58Q5T655 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP58Q5T655 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP58Q5T655 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms