Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2NLQ5JXB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2NLQ5JXB2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2NLQ5JXB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2NLQ5JXB2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2NLQ5JXB2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms