Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C3orf38Q5JPI3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C3orf38Q5JPI3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C3orf38Q5JPI3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C3orf38Q5JPI3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C3orf38Q5JPI3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C3orf38Q5JPI3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms