Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZC3H12AQ5D1E8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZC3H12AQ5D1E8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZC3H12AQ5D1E8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZC3H12AQ5D1E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H12AQ5D1E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H12AQ5D1E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms