Protein–RNA interactions for Protein: Q53S58

TMEM177, Transmembrane protein 177, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM177Q53S58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM177Q53S58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM177Q53S58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM177Q53S58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM177Q53S58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM177Q53S58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms