Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN52Q52LA3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN52Q52LA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN52Q52LA3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN52Q52LA3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN52Q52LA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN52Q52LA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms