Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKDCCQ504Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKDCCQ504Y2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKDCCQ504Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKDCCQ504Y2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKDCCQ504Y2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKDCCQ504Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKDCCQ504Y2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKDCCQ504Y2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms