Protein–RNA interactions for Protein: Q4AC94

C2CD3, C2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD3Q4AC94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD3Q4AC94 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD3Q4AC94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD3Q4AC94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2CD3Q4AC94 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C2CD3Q4AC94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD3Q4AC94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD3Q4AC94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD3Q4AC94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms