Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAM9

TUSC1, Tumor suppressor candidate gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC1Q2TAM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUSC1Q2TAM9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC1Q2TAM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC1Q2TAM9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUSC1Q2TAM9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC1Q2TAM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC1Q2TAM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC1Q2TAM9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms