Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ISXQ2M1V0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ISXQ2M1V0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ISXQ2M1V0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ISXQ2M1V0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ISXQ2M1V0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms