Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHQ16836 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHQ16836 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHQ16836 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHQ16836 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHQ16836 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHQ16836 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHQ16836 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHQ16836 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHQ16836 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HADHQ16836 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HADHQ16836 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HADHQ16836 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HADHQ16836 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHQ16836 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHQ16836 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHQ16836 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHQ16836 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHQ16836 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHQ16836 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHQ16836 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHQ16836 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHQ16836 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHQ16836 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHQ16836 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HADHQ16836 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HADHQ16836 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHQ16836 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHQ16836 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHQ16836 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHQ16836 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHQ16836 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HADHQ16836 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HADHQ16836 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HADHQ16836 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HADHQ16836 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HADHQ16836 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHQ16836 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHQ16836 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HADHQ16836 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHQ16836 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHQ16836 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HADHQ16836 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HADHQ16836 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HADHQ16836 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HADHQ16836 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HADHQ16836 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HADHQ16836 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HADHQ16836 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HADHQ16836 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HADHQ16836 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHQ16836 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHQ16836 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHQ16836 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHQ16836 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HADHQ16836 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HADHQ16836 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HADHQ16836 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HADHQ16836 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HADHQ16836 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HADHQ16836 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHQ16836 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHQ16836 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHQ16836 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHQ16836 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HADHQ16836 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HADHQ16836 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HADHQ16836 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HADHQ16836 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HADHQ16836 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HADHQ16836 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HADHQ16836 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HADHQ16836 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HADHQ16836 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HADHQ16836 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HADHQ16836 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HADHQ16836 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HADHQ16836 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HADHQ16836 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HADHQ16836 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HADHQ16836 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HADHQ16836 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HADHQ16836 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HADHQ16836 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HADHQ16836 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHQ16836 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHQ16836 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHQ16836 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHQ16836 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HADHQ16836 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms