Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R3AQ16821 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R3AQ16821 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP1R3AQ16821 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3AQ16821 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPP1R3AQ16821 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP1R3AQ16821 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP1R3AQ16821 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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