Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF9Q16594 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF9Q16594 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF9Q16594 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF9Q16594 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF9Q16594 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF9Q16594 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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