Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCAQ16586 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCAQ16586 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SGCAQ16586 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCAQ16586 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCAQ16586 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCAQ16586 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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