Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXT1Q16394 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXT1Q16394 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXT1Q16394 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXT1Q16394 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXT1Q16394 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXT1Q16394 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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