Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERC1Q15751 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC1Q15751 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERC1Q15751 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC1Q15751 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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