Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ALX1Q15699 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ALX1Q15699 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ALX1Q15699 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ALX1Q15699 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ALX1Q15699 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ALX1Q15699 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ALX1Q15699 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ALX1Q15699 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
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