Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCF4Q15080 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCF4Q15080 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF4Q15080 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCF4Q15080 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCF4Q15080 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms