Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
SHPRHQ149N8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHPRHQ149N8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHPRHQ149N8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHPRHQ149N8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SHPRHQ149N8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHPRHQ149N8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHPRHQ149N8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SHPRHQ149N8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SHPRHQ149N8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SHPRHQ149N8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
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