Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
NWD1Q149M9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NWD1Q149M9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NWD1Q149M9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NWD1Q149M9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NWD1Q149M9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NWD1Q149M9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NWD1Q149M9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NWD1Q149M9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NWD1Q149M9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NWD1Q149M9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NWD1Q149M9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NWD1Q149M9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NWD1Q149M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NWD1Q149M9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NWD1Q149M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
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