Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL19A1Q14993 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL19A1Q14993 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL19A1Q14993 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL19A1Q14993 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL19A1Q14993 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL19A1Q14993 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COL19A1Q14993 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL19A1Q14993 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms