Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMC1AQ14683 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC1AQ14683 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC1AQ14683 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC1AQ14683 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC1AQ14683 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMC1AQ14683 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMC1AQ14683 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms