Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERV3-1Q14264 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERV3-1Q14264 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERV3-1Q14264 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERV3-1Q14264 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERV3-1Q14264 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERV3-1Q14264 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERV3-1Q14264 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms