Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CNGB1Q14028 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CNGB1Q14028 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNGB1Q14028 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNGB1Q14028 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNGB1Q14028 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CNGB1Q14028 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CNGB1Q14028 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CNGB1Q14028 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CNGB1Q14028 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CNGB1Q14028 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
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