Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPSNQ13702 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAPSNQ13702 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAPSNQ13702 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAPSNQ13702 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAPSNQ13702 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPSNQ13702 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPSNQ13702 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPSNQ13702 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPSNQ13702 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPSNQ13702 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPSNQ13702 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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