Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF4BQ13523 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRPF4BQ13523 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF4BQ13523 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF4BQ13523 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF4BQ13523 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms