Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSAMPQ13449 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSAMPQ13449 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSAMPQ13449 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSAMPQ13449 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSAMPQ13449 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSAMPQ13449 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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